Мастер фимо: Магазин мастера Мастер Фимо (master-fimo) на Ярмарке Мастеров

Мастер Фимо.РУ — ЖЖ

?
Орнамент
master_fimo_ru
26 декабря, 2011

http://master-fimo.ru/articles/uroki/ornament-zavitki-na-novogodnih-sharah.html

  • Поделиться
  • Пожаловаться
Ожерелье из колец цвета металлик
master_fimo_ru
26 декабря, 2011

http://master-fimo.ru/articles/uroki/ozherele-iz-kolec-cveta-metallik.html

  • Поделиться
  • Пожаловаться
Мармеладный эффект полупрозрачной пластики
master_fimo_ru
9 февраля, 2010

 

Для изготовления таких бусин вам потребуется:
— полимерная глина Fimo Soft белый 8020-0;
— полимерная глина Fimo Effect полупрозрачный белый 8020-014;

— полимерная глина любого оттенка зеленого, в данном случае использовались  полимерная глина Fimo Soft лайм 8020-50 и Полимерная глина Fimo Soft тропический зелёный 8020-53;
— доска для лепки;
— акриловый роллер Sculpey;
— нож для пластики;
— канцелярская линейка;
— глянцевый лак на водной основе (8704-01);
— зубочистки;
— фольга для запекания.

Весь урок здесь

Метки: fimo, полимерная глина

  • Поделиться
  • Пожаловаться
Паста-машина. Техническое обслуживание своими руками
master_fimo_ru
9 февраля, 2010

 

 

Паста-машина, как и все механизмы, нуждается в периодическом техническом обслуживании, а именно в смазке движущихся и трущихся деталей.

Чтобы разобрать паста-машину, нужно проделать несколько несложных операций:

 

Вся статья здесь

Метки: паста-машина

  • Поделиться
  • Пожаловаться
История создания полимерной глины. Часть I
master_fimo_ru
9 февраля, 2010

Человек занимается творчеством с покон веков. Украшения и предметы быта изготавливали из глины с незапамятных времён. А когда же появилась полимерная глина ? И что это за странное название: «Полимерная глина»? Чем она отличается от обычной, всем известной глины?

Название «полимерная глина» (Polymer Clay) этот материал получил потому, что состоит он из искусственных материалов (полимеров), а в остальном напоминает глину, то есть такой же эластичный, как глина и так же, как и обычную глину, его нужно запекать для придания прочности. В России прижилось название «пластика» (от названия питерской продукции «пластика «Цветик»). Откуда они выдумали такое название только им известно, наверное, чтобы было не как у всех.

Вся статья здесь

Метки: fimo, полимерная глина

  • Поделиться
  • Пожаловаться
Валентинки
master_fimo_ru
7 февраля, 2010

 

 

 

Вам потребуется:
— полимерная глина Fimo Soft вишнёвый
8020-26;
— глянцевый лак на водной основе;

— каттеры формы сердца;
— перья белого цвета;
— супер клей для пластики;
— красный вощеный шнур;
— держатель для кулона цвет серебристый.

 

 Весь урок здесь

Метки: fimo, валентинки из фимо, полимерная глина

  • Поделиться
  • Пожаловаться

MEME/fimo-tutorial.html на master · cinquin/MEME · GitHub

.
......
<голова>
<метакодировка="utf-8">
Учебное пособие по FIMO — MEME Suite
png»>
<скрипт src="js/menu.js">
<тело>
<дел>

Комплекс цМемов

Инструменты анализа последовательностей на основе мотивов

Учебное пособие по FIMO

Что делает FIMO

<дел>

Типичные приложения FIMO

<ул>
  • Определение всех положений, в которых мотив фактора транскрипции (TF) совпадает в одном или нескольких
  • промоторных последовательностей.
  • Предсказание точного места связывания TF в каждом из своих пиков ChIP-seq с использованием известного мотива (из одного
  • предоставленных баз данных) или мотив de novo, обнаруженный с помощью алгоритма обнаружения мотива
    , такие как MEME или DREME.
  • Определение всех положений, в которых белковый мотив совпадает в одной или нескольких белковых последовательностях.
  • Как работает FIMO

    <р>
    FIMO преобразует каждый входной мотив в PSSM с логарифмическими шансами и использует каждый PSSM для независимого сканирования каждого входа
    последовательность. Он сообщает обо всех позициях в каждой последовательности, которые соответствуют мотиву со статистически значимым логарифмическим шансом
    баллов. Вы можете управлять значением соответствия p, которое считается значимым, а также тем, 9 или нет.0006
    FIMO сообщает о совпадении обеих цепей, когда алфавит последовательности является комплементарным (например, ДНК или РНК).

    Алфавиты последовательностей и мотивов

    <р>
    FIMO поддерживает алфавиты ДНК, РНК, белков и пользовательских последовательностей. Алфавит указан в файле мотива,
    , и искомые последовательности должны быть совместимы с этим алфавитом. (Мотивы ДНК могут быть использованы для поиска
    последовательности РНК и наоборот.)

    База данных последовательностей

    <р>
    Все эти последовательности должны быть в одном алфавите последовательностей. Их длина может быть разной.
    Они могут, например, представлять собой набор промоторов, которые, как считается, совместно регулируются, набор областей ChIP-seq или
    протеом организма.

    Часто задаваемые вопросы

    <ул>
  • Когда следует использовать FIMO, а не MAST?
  • MAST предназначен для поиска «коротких» последовательностей, таких как белки,

    , тогда как FIMO больше подходит для последовательностей любой длины.
    Кроме того, MAST сообщает об одной оценке для каждой отсканированной последовательности, которая
    сочетает в себе наилучшее совпадение с каждым мотивом на входе.
    Таким образом, MAST наиболее полезен, когда вам нужен способ ранжирования последовательностей
    в зависимости от того, насколько хорошо каждая последовательность соответствует всем (или многим) вашим мотивам.
    FIMO никоим образом не объединяет результаты матчей и сообщает обо всех
    соответствует отдельно, поэтому полезно, когда вы хотите точно знать
    , где сигналы, описываемые вашими мотивами, расположены в каждой входной последовательности.

  • Имеет ли смысл сканировать весь геном с мотивами факторов транскрипции с помощью FIMO?
  • Вероятно, это плохая идея по нескольким причинам, и она может быть предпочтительнее

    сосредоточены на более коротких областях, таких как промоторы, энхансеры или пиковые области ChIP-seq.
    Также, если они у вас есть, FIMO может использовать дополнительные источники информации,
    , как гиперчувствительность к ДНКазе, чтобы помочь отличить случайные совпадения от
    биологически значимых. Более подробная информация об этом доступна в
    Документация FIMO об использовании html> априорных значений позиции.

    <р>
    Первая проблема при сканировании генома заключается в том, что геномы очень большие, а фактор транскрипции
    Родство не очень специфично. Мотивы обычно имеют только 8 оснований или менее
    специфичности, и все 8-меры встречаются в эукариотическом геноме много миллионов раз.

    <р>
    Другой взгляд на эту проблему состоит в том, что когда вы используете FIMO для сканирования эукариотического генома, вы
    имеют серьезную проблему множественного тестирования. Пороговое значение p соответствия FIMO по умолчанию составляет 0,0001,
    и сканирование генома эукариот применили бы этот тест миллиарды раз.
    Это означает, что вы получите сотни тысяч совпадений совершенно случайно.
    Они, скорее всего, полностью превзойдут биологически значимые совпадения.
    При сканировании чего-то вроде генома мыши, например, вам придется применить
    очень строгое совпадение, пороговое значение, 1e-10, чтобы уменьшить количество ложных срабатываний до чего-то
    разумно.

    Вы можете несколько уменьшить проблему многократного тестирования, используя версию командной строки

    FIMO и с использованием порогового значения q, а не порогового значения p.
    Значение q похоже на значение p, но скорректировано для многократного тестирования.
    Как и значение p, значение q 0,01 или меньше является разумным
    порог значимости. Однако для вычисления q-значений
    FIMO должен хранить все совпадения в памяти. При сканировании полного генома это может
    легко требуют десятки ГБ памяти. Чтобы избежать проблем с памятью,
    FIMO ограничивает количество результатов, которые будут храниться в памяти, до 100 000.
    При использовании версии с командной строкой это можно настроить с помощью параметра
    Опция --max-stored-scores. Каждый раз, когда FIMO достигает
    Максимально допустимое количество сохраненных оценок, это уменьшит пороговое значение p
    , пока он не устранит хотя бы половину очков.

    Чтобы решить проблему с памятью, вы можете использовать параметр --text. Это отключает

    полностью вычисляет q-значения и указывает FIMO распечатывать каждое совпадение по мере его возникновения.
    Вы можете использовать это, чтобы получить полный список с желаемым пороговым значением p.
    Однако это не устраняет проблему многократного тестирования. Если вы не установите строгий
    Пороговое значение p, при котором биологически значимые совпадения будут превышены
    по совпадениям, которые статистически значимы из-за случайности. Обратите внимание, что короткий
    мотивов представляют собой особую проблему, потому что даже идеальное совпадение не может быть
    сильно статистически значимо, так что порог достаточно строгий
    для устранения случайных совпадений приведет к удалению всех совпадений.

  • Имеет ли смысл сканировать все промоторы в геноме с мотивами факторов транскрипции с помощью FIMO?
  • <р>
    Возможно, но только если ваше определение «промоутер» короче 1000 п. н.

    <р>
    По умолчанию FIMO использует пороговое значение p, равное 0,0001, и сканирует обе нити ДНК, так что
    означает, что вы будете ожидать примерно одно «совпадение» каждые пять промоутеров просто случайно, что может быть приемлемым
    ложноположительных результатов (20%), в зависимости от того, что вы собираетесь делать дальше. (Приблизительная) формула
    : #false-positives/promoter = (2 * длина промоутера) * пороговое значение p.

    <р>
    Если ваши промоутеры длиннее 1000 п. н., вам потребуется уменьшить пороговое значение p
    для компенсации. Для промоутеров на 5000 п.н. необходимо разделить пороговое значение p на
    пять, что дает пороговое значение 0,00002. Проблема в том, что для некоторого фактора транскрипции
    мотивов, наилучшее соответствие мотиву не имеет значения на этом уровне.
    Следовательно, рекомендуется ограничить поиск FIMO с мотивами TF промоторными областями не длиннее
    1000 бп.

    <р>
    Более подробное обсуждение этих вопросов множественного тестирование исправительной работы» У. Ноубла (Nature Methods 27:1135-9, 2009). Пример CTCF на рисунке 1 в этой статье был сгенерирован с использованием FIMO.

  • Должен ли я использовать фоновую модель с FIMO?
  • <р>
    Да, безусловно.

    <р>
    Если вы используете FIMO через Интернет и выбираете одну из баз данных последовательностей
    , FIMO будет использовать фоновую модель, основанную на базовых (или остаточных) частотах в последовательностях
    вы выбираете.

    <р>
    Если вы запускаете FIMO из командной строки, вам необходимо создать и предоставить FIMO
    соответствующий фон модели фона. Сделать это можно скриптом
    fasta-get-markov. Если ваш
    входные последовательности разнообразны и содержат несколько оснований/остатков или более,
    вы можете просто запустить этот скрипт на ваших входных последовательностях, чтобы создать фон
    Модель. Кроме того, вы можете создать фоновую модель таким же образом
    из большого набора случайно выбранных участков последовательности. Эти последовательности должны
    быть биологически похожими на последовательности, которые вы собираетесь сканировать с помощью FIMO.

    <р>

    Мастер-класс по полимерной глине — Совет Национальной библиотеки Сингапура

    Мастер-класс по полимерной глине — Совет Национальной библиотеки Сингапура — OverDrive

    Ошибка загрузки страницы.
    Попробуйте обновить страницу. Если это не сработает, возможно, возникла проблема с сетью, и вы можете использовать нашу страницу самопроверки, чтобы узнать, что мешает загрузке страницы.
    Узнайте больше о возможных проблемах с сетью или обратитесь в службу поддержки за дополнительной помощью.


    Поиск Расширенный Изучите фирменные техники лучших мастеров по полимерной глине
    Мастер-класс по полимерной глине предлагает вам подробно рассмотреть творческие процессы одиннадцати известных мастеров по полимерной глине, которые делятся своим опытом друг с другом и с вами. Джуди Белчер и Тамара Хонаман впервые объединяют этих талантливых художников, предлагая свои индивидуальные техники, а затем документируя, как они вдохновляют и бросают вызов друг другу в создании совместных работ. За пять уроков с шестнадцатью управляемыми проектами вы получите представление о навыках работы с полимерной глиной, которыми всегда хотели овладеть, например:
    • Создание с помощью скульптуры, ткачества и имитации
    • Изменение поверхности с помощью резьбы, переноса, оттиска и трафаретной печати
    • Включение смешанных материалов, таких как металл, дерево и волокно
    • Проектирование с использованием холодных соединений, полых и легких формы, кинетическое конструирование и методы отделки ювелирных изделий
    • Расширение границ техники смешения Скиннера
    • Сотрудничество с коллегами-художниками для открытия новых творческих возможностей
    С участием Лесли Блэкфорд, Синтии Тинаппл, Линдли Хаунани, Сары Шрайвер и многих других другие, у вас есть место в первом ряду в мире инновационного искусства полимерной глины. Бросьте вызов своим представлениям о методах, стиле и сотрудничестве и приготовьтесь начать собственное творческое путешествие.
     
    Также доступна в виде электронной книги
    Ремесла Документальная литература
    • Детали